Programa

24 de febrero

  • Conceptos básicos: Biología celular y molecular
  • Introducción: Bioinformática
  • Bases de datos y servidores remotos NCBI, EBI, DDBJ, Swiss-Prot
  • Búsqueda de secuencias de nucleótidos y proteínas, formatos de secuencias
  • Búsqueda de secuencias homologas (BLAST)
    Alineamientos de nucleótidos y proteínas  (CLUSTAL)
  • Alineamientos múltiples
  • Clonación de genes: Diseño de oligonucleótidos para PCR (Primer3), vectores de clonación, construcción teórica del ADN recombinante
  • Secuenciación de genes (BioEdit)

25 de febrero
Análisis de la estructura de proteínas (EXPASY)

  • Predicción de la estructura primaria (Traslate, MotifScan, PROSITE, Superfamily, |Pfam)
  • Predicción de la estructura secundaria (nnPredictor, PHD, JPred, SCOP, CATH),
  • Predicción y análisis  de la estructura terciaria (SwissModel, Geno3D, PDB)
  • Predicción y análisis de la estructura cuaternaria de proteínas (PatchDock)
  • Trabajos libres con secuencias problemas
    Discusión

Características: Teórico-práctico
Dirige: Dra. Nora Hilda Rosas Murrieta
Profesor-Investigador Titular A Tiempo completo en el Centro de Química del Instituto de Ciencias de la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla

 

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